Cómo facturar como fisioterapeuta: IVA, IRPF y modelo de factura

Saber cómo facturar como fisioterapeuta parece sencillo hasta que llega el primer caso raro: un paciente que pide la factura a nombre de su empresa, una aseguradora que te exige un formato concreto, un bono de diez sesiones cobrado por adelantado o una crema que vendes en recepción. Cada uno tiene su tratamiento de IVA y de IRPF, y un error repetido durante meses se convierte en un problema serio cuando tu asesoría cierra el trimestre.

Esta guía está pensada para el dueño o la dueña de una clínica de fisioterapia y para el fisioterapeuta autónomo. Repasamos cuándo estás exento de IVA y dónde acaba esa exención, en qué facturas hay que aplicar retención de IRPF, qué datos exige el Reglamento de facturación, cuándo vale una factura simplificada, cómo se corrigen los errores y cómo facturar a mutuas, empresas y bonos. Al final tienes un modelo de factura de fisioterapia campo por campo. Aunque un buen programa de gestión para fisioterapeutas aplica estas reglas de forma automática, conviene que las entiendas para revisar lo que facturas.

¿Lleva IVA la factura de un fisioterapeuta?

La regla general es que no. El artículo 20.Uno.3.º de la Ley 37/1992 del IVA declara exenta «la asistencia a personas físicas por profesionales médicos o sanitarios», y los fisioterapeutas son profesionales sanitarios. La exención es objetiva: se aplica por la naturaleza del servicio, no por quién lo presta, así que también alcanza a la clínica constituida como sociedad cuando la asistencia la realizan fisioterapeutas.

La misma norma aclara que la exención se aplica cualquiera que sea la persona destinataria de los servicios. Esto importa cuando no te paga el paciente, sino una aseguradora, una mutua o una empresa: si el servicio es asistencia sanitaria a una persona, sigue exento.

Dónde acaba la exención de IVA en fisioterapia

La clave es la finalidad. Para que la sesión esté exenta tiene que servir para prevenir, diagnosticar, tratar o curar un problema de salud. Cuando el servicio persigue otra cosa (estética, relajación, bienestar general, rendimiento sin un problema que tratar), la exención deja de aplicarse. Esta tabla resume los casos más frecuentes:

Si en una misma factura juntas sesiones exentas y un producto con IVA, el reglamento obliga a separar la base de cada operación: una línea exenta con su mención y otra con su tipo y su cuota de IVA.

Qué implica estar exento de IVA

La exención no es solo una ventaja. Como no repercutes IVA en tus sesiones, tampoco puedes deducirte el IVA que pagas en alquiler, material o software: pasa a ser un coste más. Si una parte de tu facturación sí lleva IVA (venta de productos, servicios de bienestar), entras en un régimen de prorrata y la deducción se calcula según la proporción. Y si solo haces operaciones exentas, en general no tienes que presentar las autoliquidaciones periódicas de IVA; en cuanto empiezas a vender productos, sí. Revísalo con tu asesoría antes de ampliar servicios.

¿Cuándo lleva retención de IRPF la factura de fisioterapia?

La fisioterapia es una actividad profesional (en el IAE figura en el grupo 836 de la sección de profesionales, «Ayudantes técnicos sanitarios y fisioterapeutas»). Por eso, cuando un fisioterapeuta autónomo factura a quien está obligado a retener, en la factura se descuenta un porcentaje a cuenta de su IRPF. Quien te paga ingresa esa cantidad en Hacienda en tu nombre. Si todavía estás con los trámites de inicio, la guía para darte de alta como fisioterapeuta autónomo (IAE e IRPF) los repasa paso a paso.

La retención se calcula sobre la base de la factura, sin incluir el IVA. Por ejemplo, un fisioterapeuta que colabora con una clínica y le factura 1.600 € en sesiones exentas aplica un 15 %: la factura muestra 1.600 € de base, una retención de 240 € y un total a cobrar de 1.360 €.

Qué datos debe llevar una factura de fisioterapia

El contenido obligatorio lo fija el artículo 6 del Reglamento de facturación (Real Decreto 1619/2012). Una factura completa de fisioterapia debe incluir:

• Número y, en su caso, serie, con numeración correlativa dentro de cada serie.
• Fecha de expedición y, si es distinta, la fecha de la sesión o del cobro anticipado.
• Nombre y apellidos o razón social, NIF y domicilio de quien emite la factura.
• Nombre y apellidos o razón social, NIF y domicilio del destinatario.
• Descripción del servicio, con precio unitario sin impuestos y descuentos si los hay.
• Tipo de IVA aplicado y cuota, o la mención de que la operación está exenta.
• Retención de IRPF, cuando corresponda.
• Si la emites con un programa informático adaptado a la normativa antifraude, el código QR y, en su caso, la leyenda de factura verificable.

Modelo de factura de fisioterapia (ejemplo)

Así quedaría una factura completa emitida por un fisioterapeuta autónomo a un paciente particular por cuatro sesiones. Los datos son ficticios:

Factura simplificada o completa: ¿cuál das a tus pacientes?

Un error muy extendido es pensar que, como la fisioterapia está exenta de IVA, no hay que hacer factura. No es así: el artículo 3 del Reglamento exime de facturar algunas operaciones exentas, pero excluye expresamente la asistencia sanitaria del artículo 20.Uno.3.º. Cada cobro a un paciente debe quedar documentado.

Lo que sí puedes elegir es el tipo de factura. Cuando el importe no supera 400 € con IVA incluido, basta con una factura simplificada (lo que muchos llaman ticket), que tiene menos datos.

Dos detalles prácticos. Si en un mismo año emites simplificadas y completas, tienen que ir en series separadas. Y si un paciente al que diste una simplificada te pide después una completa con sus datos, puedes emitirla en sustitución de la anterior; el reglamento aclara que ese canje no es una rectificativa.

En cuanto al plazo, la factura se expide en el momento de la operación. Cuando el destinatario es un empresario o profesional, puedes emitirla hasta antes del día 16 del mes siguiente, lo que permite una factura mensual a aseguradoras y empresas.

Facturas rectificativas: cómo corregir un error

Si una factura sale con un importe equivocado, a nombre de otra persona o con el IVA mal aplicado, no se edita ni se borra: se emite una factura rectificativa. Es obligatoria cuando la original no cumple los requisitos o cuando cambia la base (por ejemplo, devuelves el importe de sesiones no realizadas).

1. Detecta y decide. Comprueba qué dato falla y si afecta al importe, al destinatario o solo a un dato formal.
2. Usa la serie de rectificativas. El reglamento exige que las rectificativas vayan en una serie específica, por ejemplo «R2026».
3. Identifica la original. Indica número y fecha de la factura rectificada y qué se modifica.
4. Expresa la corrección. Puedes indicar solo la diferencia (con su signo) o cómo quedan los importes tras rectificar, señalando la diferencia.
5. Hazlo a tiempo. En cuanto tengas constancia del error, y como máximo dentro de los cuatro años siguientes al devengo.

Un programa preparado para la normativa antifraude no te dejará modificar una factura emitida, precisamente para que la corrección quede siempre a la vista.

Cómo facturar a mutuas, aseguradoras, empresas y bonos

Aquí es donde más se complican las cosas en una clínica, porque quien recibe la factura no es la persona tratada.

Aseguradoras de salud y mutuas

La sesión sigue exenta de IVA, porque es asistencia sanitaria a una persona física aunque pague un tercero. La factura va a nombre de la entidad, con sus datos fiscales, y suele acompañarse de la información que exige el convenio: número de autorización, póliza o expediente y sesiones realizadas por paciente. Si eres autónomo, lleva retención de IRPF. Lo habitual es emitir una factura mensual por entidad, antes del día 16 del mes siguiente.

Empresas, clubes y otros profesionales

Si una empresa contrata sesiones para su plantilla o un club para sus jugadores, la asistencia sigue exenta cuando tiene finalidad sanitaria. Ojo con los servicios que se venden como «bienestar» sin un problema que tratar: ahí puede haber IVA. Lo mismo vale para el fisioterapeuta autónomo que colabora con una clínica: factura a la clínica sus sesiones exentas y aplica retención.

Bonos y pagos por adelantado

Cuando un paciente paga un bono de varias sesiones por adelantado, el criterio más prudente es emitir la factura en el momento del cobro, con un concepto como «Bono de 10 sesiones de fisioterapia», y controlar en la agenda las sesiones consumidas. Si al final devuelves parte del importe por sesiones no realizadas, lo documentas con una rectificativa. Cómo poner precio a esos bonos sin perder margen lo explicamos en la guía sobre cuánto cobrar por una sesión de fisioterapia, y cómo gestionarlos (caducidad, devoluciones, control de sesiones) en la de bonos de sesiones de fisioterapia.

La facturación limpia empieza en la agenda: si cada cita, cada bono y cada cobro quedan registrados en el mismo sitio, la factura se hace sola y cuadra con la caja.

VeriFactu: lo que cambia en tu forma de facturar

A todo lo anterior se suma el reglamento de sistemas informáticos de facturación, conocido como VeriFactu. Si emites facturas con un programa, ese programa debe generar registros encadenados que no se puedan alterar y añadir un código QR a cada factura. Según el calendario vigente, las sociedades deben estar adaptadas antes del 1 de enero de 2027 y los autónomos antes del 1 de julio de 2027. Lo tienes detallado en nuestra guía de VeriFactu para fisioterapeutas.

En la práctica, esto hace que las plantillas de Word o las hojas de cálculo dejen de ser una opción razonable para la mayoría de clínicas. Si trabajas solo y estás valorando herramientas, en la guía de software para fisioterapeutas autónomos tienes qué pedirle a un programa. Si llevas una clínica con varios profesionales, conviene que la facturación viva en el mismo software de gestión para tu clínica donde está la agenda, para no copiar datos a mano.

Resumen y errores habituales al facturar como fisioterapeuta

Facturar bien en fisioterapia se reduce a responder cuatro preguntas en cada cobro: qué servicio es (sanitario o no), a quién facturas (particular o entidad), qué tipo de factura toca (simplificada o completa) y en qué serie va. Estos son los errores que más vemos:

Si quieres dejar de hacer todo esto a mano, el programa de facturación para fisioterapeutas de Fisionexa emite facturas y rectificativas por series, con el IVA o la exención que corresponda a cada servicio, y genera los registros de VeriFactu desde la misma agenda donde gestionas las citas y los bonos. Puedes verlo funcionando en la demo interactiva.

Este artículo es informativo y no sustituye el asesoramiento fiscal. Los criterios sobre exenciones, retenciones y plazos pueden cambiar o depender de tu caso concreto: confírmalos con tu asesoría.